I jak ta historia się skończyła? Bo właśnie zrobiłem ten sam błąd -> nie chciało mi znaleźć flash_all_except_data_storage.bat więc zacząłem grzebać. Tak więc pierwsze co odpaliłem to Other -> Check Sha256 -> Check All i zdziwiony, że zaczął flashować... no, ale wygląda to na zadanie diagnostyczne, bo w końcu sha256 to algorytm hashowania, więc nic nie powinno się faktycznie zmienić.
Edit: Tak jak się spodziewałem, nic się nie psuje kiedy przerwiemy ten 'flashing', bo faktycznie żadne flashowanie w tym momencie nie zachodzi.